重庆中医药大学有省级重点学科2个、重庆市高校特色专业1个（中医学）、重庆市一流专业2个（中医学、中药学）、中医药特色学科专业群1个、国家级卓越医生（中医）教育培养计划试点1个，与重庆医科大学共建共享博士学位授权点1个、硕士学位授权点3个，省部级以上科研平台14个、国家级中医药优势特色教育培训基地1个、国家级中药学继续教育基地1个。
首批规划设置中医学、中药学、针灸推拿学、中医骨伤科学、中西医临床医学、中药制药6个本科专业，2022年计划招生1200人，到2025年全日制在校学生（含研究生）达到6000人，到2030年全日制在校学生（含研究生）达到10000人。
重庆医科大学中医药学院组建于2001年，是重庆市建立最早的中医药高等教育基地。办学类型涉及普通高等教育、成人高等教育、继续教育、对外中医药教育等多种形式，形成了以人才培养高层次、教育教学特色化为发展方向的中医药高等教育体系。
现有2个省级重点学科（中西医结合临床、中医内科学）；4个二级学科硕士学位授权点（中西医结合基础、中西医结合临床、针灸推拿学、中医临床基础）。
有9个本科专业及方向（中医学、中西医临床医学、中医康复治疗学、中医骨伤科学、针灸推拿学、中药学、中药制剂学、中药制药学、中药分析与鉴定）、6个专科专业（中西医临床医学、针灸推拿学、中医骨伤科学、中药学、中药分析与鉴定、中药资源开发与应用）。
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